1、单位不同：涉税专业服务机构在税务部门有登记，是受税务部门监管的专业单位。纳税人税务登记是纳税人向税务机关办理登记的一种手续，是法定手续。

2、业务不同：涉税专业服务机构接受委托，利用专业知识和技能，就涉税事项向委托人提供的税务代理等服务。纳税人税务登记是税务机关依据税法规定，对纳税人的生产、经营活动进行登记管理的一项法定制度。

纳税服务是政府和社会组织根据税收法律、行政法规的规定，在纳税人依法履行纳税义务和行使权利的过程中，为纳税人提供的规范、全面、便捷、经济的各项服务措施的总称。